现在的战役模式和之前的老版本已经大不相同，战役发生在一个称为塞普罗的星球，在战役模式中有三个阵营，你在Sharded队，也是黄队，这个星球的进攻者。敌人在Crux队，也是红队，这个星球的守卫者。而还有一个特殊的队伍叫Derelict，也是灰队，就是废弃的建筑，玩家可以拆解或重建来利用灰队。

而地区也有两种，主线和支线。支线是由系统随机生成的。地图，资源，敌人，波数，模式都是完全随机，并用数字编号命名。而主线则是人工设置，拥有自己的名字，占领后还有相应的科技树解锁，比如方块，单位。 p.s.:主线同样具有编号，但只存在于源文件中

被占领的地区也有可能被攻击，如果地区旁边有红框的敌人基地，那么该地区就可能被攻击。敌人将会不断攻击至区域丢失，重新占领地区必须要完成新增的波数，当然占领敌人基地可以一劳永逸的解决被攻击之苦。

科技树选项处可以看见全球的资源总和，因此，区块后台生产资源可以在玩家所在位置之外的所有地方运行，同时上述的敌人袭击也可以在后台计算。与5.0版本不同的是，现在核心会焚烧掉多余的物品，发射台只能在不同区块发送，而没有了所谓的“全局资源”。